Генная инженерия в биотехнологии (семинары). Учебное пособие

Список сокращений
Предисловие
Занятие I. Ферменты генетической инженерии.
Эндонуклеазы рестрикции
1.1. Структура ДНК
1.2. Эндонуклеазы рестрикции
1.3. Метилтрансферазы
1.4. Задачи к занятию 1
1.5. Вопросы и задачи на повторение к занятию 1
Занятие 2. Ферменты генетической инженерии
(продолжение)
2.1. Лигаза
2.2.Щелочная фосфатаза
2.3. Полимеразы
2.3.1. ДНК-полимераза I Е. coli
2.3.2. ДНК-полимераза фага Т4
2.3.3. РНК-зависимая ДНК-полимераза, или
обратная транскриптаза
2.4. Терминальная
дезоксинуклеотидилтрансфераза
2.5. Полинуклеотидкиназа фага Т4
2.6. Нуклеазы
2.6.1. Нуклеаза S1
2.6.2. Нуклеаза Ва131
2.6.3. Другие нуклеазы
2.7. Задачи к занятию 2
2.8. Вопросы и задачи на повторение к занятию 2
Занятие 3. Полимеразная цепная реакция (ПЦР)
3.1. Принцип ПЦР
3.2. Выбор полимеразы
3.3. Подбор праймеров
3.4. Процедура постановки ПЦР
3.5. Контроли ПЦР
3.6. Детекция результатов ПЦР методом
гель-электрофореза
3.7. Оптимизация ПЦР
3.8. Области применения ПЦР
3.9. Типы ПЦР
3.9.1. Градиентная ПЦР
3.9.2. Мультиплексная ПЦР
3.9.3. Вложенная (nested) ПЦР
3.9.4. ПЦР с использованием вырожденных
праймеров
3.10. Перспективы использования ПЦР
3.11. Задачи к занятию 3
3.12. Вопросы и задачи на повторение к занятию 3
Занятие 4. Секвенирование ДНК
4.1. Секвенирование ДНК по Сэнгеру
(метод терминирующих нуклеотидов)
4.2. Стратегия секвенирования протяженных
участков
4.3. Методы секвенирования следующего
поколения (NGS)
4.4. Задачи к занятию 4
4.5. Вопросы и задачи на повторение к занятию 4
Занятие 5. Молекулярные ДНК-маркеры
5.1. Маркеры, основанные на использовании
рестрикции: ПДРФ (полиморфизм длин
рестрикционных фрагментов)
5.2. Методы, основанные на ПЦР
5.2.1. RAPD
5.2.2. STR
5.2.3. Идентификация SNP
5.3. Комбинированные методы: AFLP, или
полиморфизм длин амплифицированных фрагментов
5.4. Секвенирование специфических
последовательностей
5.5. Применение молекулярных маркеров
5.5.1. Судебно-медицинская экспертиза
5.5.2. Филогенетические исследования
5.5.3. Построение генетических карт
5.5.4. Диагностика заболеваний
5.6. Задачи к занятию 5
5.7. Вопросы и задачи на повторение к занятию 5
Занятие 6. Молекулярное клонирование
6.1. Векторы для клонирования
6.2. Бактериальные штаммы для клонирования
и экспрессии генов
6.3. Клонирование протяженных участков.
Библиотеки генов
6.4. Подготовка фрагмента к клонированию
6.5. Молекулярное клонирование
6.6. Отбор клонов с рекДНК
6.7. Задачи к занятию 6
6.8. Вопросы и задачи на повторение к занятию 6
Занятие 7. Методы идентификации трансгена и
изучения его экспрессии. Методы изучения
глобальной экспрессии генов
7.1. Методы идентификации трансгена
7.2. Изучение экспрессии генов на уровне РНК
7.2.1. Нозерн-блот-анализ
7.2.2. ОТ-ПЦР (ПЦР с обратной транскрипцией)
7.2.3. ПЦР-РВ (ПЦР в реальном времени)
7.2.4. Изучение глобальной экспрессии генов
на уровне РНК
7.3. Изучение экспрессии генов на уровне белка
7.3.1. Вестерн-блоттинг
7.3.2. Двумерный гель-электрофорез
7.3.3. Масс-спектрометрия
7.3.4. Изучение глобальной экспрессии генов
на уровне белка
7.4. Задачи к занятию 7
7.5. Вопросы и задачи на повторение к занятию 7
Решения задач
Приложение
Список использованной литературы