РНК. Синтез и функции. Учебное пособие

От редактора
Предисловие
Введение
1. Структура РНК, основные типы РНК
2. Общая характеристика процесса транскрипции
Литература
Глава 1. Синтез РНК в клетках эубактерий
1.1. Промоторы прокариотических генов,
оперонная организация транскрипционных единиц
1.2. РНК-полимераза Е. coli
1.2.1. Структура фермента
1.2.2. Принцип работы РНК-полимеразы Е. coli
1.2.3. Терминация транскрипции
1.3. Заключение
Литература
Глава 2. Регуляция транскрипции у эубактерий
2.1. Лактозный оперон Е. coli и регуляция его
экспрессии
2.2. Регуляция экспрессии арабинозного оперона Е.
coli
2.3. Триптофановый оперон Е. coli и регуляция его
экспрессии
2.4. Другие примеры регуляции за счет
преждевременной терминации транскрипции
2.5. ДНК-связывающие домены прокариотических
белков
2.6. Прокариотические энхансеры
2.7. Сигнальная трансдукция у бактерий
2.8. Регуляция транскрипции путем смены
о-субъединиц
2.9. Заключение
Литература
Глава 3. Синтез РНК в клетках эукариот
3.1. Общая характеристика эукариотических
РНК-полимераз
3.2. РНК-полимераза II
3.2.1. Промоторы РНК-полимеразы II
3.2.2. Базальные транскрипционные факторы
РНК-полимеразы II
3.2.3. Комплексы белков, ассоциированных с
РНК-полимеразой II
3.2.4. Терминация транскрипции и
полиаденилирование 3'-конца мРНК
3.3. РНК-полимераза I
3.4. РНК-полимераза III
3.5. Биогенез ядерных РНК-полимераз и их
посттранскрипционная судьба
3.5.1. Синтез белков, входящих в состав
полимераз, и сборка субкомплексов РНК-полимераз
в цитоплазме; вспомогательные факторы сборки
3.5.2. Транспорт РНК-полимеразы II в ядро и сборка
РНК-полимераз I и III
3.5.3. Деградация полимераз после завершения
цикла и рециклинг
3.6. Заключение
Литература
Глава 4. Созревание транскриптов у эукариот
4.1. Посттранскрипционная модификация мРНК
4.1.1. Кэпирование 5'-конца мРНК
4.1.2. Редактирование мРНК
4.2. Созревание первичных транскриптов рРНК
4.3. Созревание первичных транскриптов
РНК-полимеразы III
4.4. Заключение
Литература
Глава 5. Регуляция транскрипции у эукариот
5.1. Активация и репрессия генов,
транскрибируемых РНК-полимеразой II
5.2. Регуляция утилизации галактозы у дрожжей
5.3. Механизм глюкозной репрессии у дрожжей
5.4. Регуляция ответа эукариотической клетки на
тепловой шок
5.5. Сигнальная трансдукция
5.5.1. Внутриклеточные рецепторы
5.5.2. Рецепторы, представляющие собой
трансмембранные белки
5.5.3. Рецепторы, ассоциированные с ионными
каналами
5.5.4. Рецепторы, ассоциированные с G-белками
5.6. Регуляция активности РНК-полимераз I и III
5.7. Заключение
Литература
Глава 6. Мозаичная структура эукариотических
генов. Сплайсинг
6.1. Сплайсинг цитоплазматических тРНК
6.2. Сплайсинг мРНК
6.3. Альтернативный сплайсинг
6.4. Транс-сплайсинг
6.5. Автосплайсинг
6.6. Митохондриальные интроны дрожжей;
мобильность интронов I и II типов
6.7. Заключение
Литература
Глава 7. Каталитические свойства РНК. Мир РНК
7.1. Структура и функции рибозимов
7.2. Мир РНК
7.3. Использование рибозимов в прикладных целях
7.4. Заключение
Литература
Глава 8. Ремоделирование хроматина и
транскрипция
8.1. Структура хроматина и нуклеосомы
8.2. Посттрансляционная модификация гистонов
8.2.1. Ацетилирование гистонов
8.2.2. Деацетилазы гистонов
8.2.3. Метилирование гистонов
8.2.4. Другие модификации гистонов
8.2.5. Неканонические гистоны
8.2.6. Комплексы ремоделирования хроматина
8.2.7. Семейство SWI/SNF
8.2.8. Семейство INO80
8.2.9. Пространственная структура комплексов
INO80 и SWR1
8.2.10. Семейство ISWI
8.2.11. Комплексы ISWI дрожжей
8.2.12. Комплексы ISWI человека
8.2.13. Пространственная структура комплексов
семейства ISWI
8.2.14. Семейство CHD
8.2.15. Механизм действия комплексов
ремоделирования хроматина
8.3. Заключение
Литература
Глава 9. Пространственная организация процессов
транскрипции в ядре эукариот
9.1. Внутренняя мембрана клетки и ламина
9.2. Ламина
9.3. Ядерный поровый комплекс и транскрипция
9.4. Хромосомы и хромосомные территории
9.5. Транскрипционные фабрики и организация
транскрипции
9.6. Заключение
Литература
Глава 10. РНК и трансляция
10.1. Транспортные РНК
10.2. Рибосомные РНК
10.3. Заключение
Литература
Глава 11. РНК как регулятор у бактерий
11.1. Антисмысловые РНК эубактерий
11.2. Малые регуляторные РНК бактерий
11.3. Системы CRISPR - Cas у архей и эубактерий
11.4. Рибосвитч
11.5. Транспортно-матричные РНК
11.6. Заключение
Литература
Глава 12. РНК как регулятор у эукариот
12.1. Косупрессия у растений и аналогичные
явления у других организмов
12.2. Обнаружение микроРНК (miPHK), их биогенез и
функции
12.3. Малые интерферирующие РНК (siPHK)
12.4. Другие типы малых интерферирующих РНК
12.5. Регуляция транскрипции с помощью 7SK РНК
12.6. Длинные некодирующие РНК
12.7. Заключение
Литература
Глава 13. Внутриклеточный транспорт РНК
13.1. Экспорт мРНК
13.2. RAN-зависимый экспорт РНК
13.3. Роль РНК в секреции белков
13.4. Заключение
Литература
Глава 14. Деградация РНК
14.1. Деградация нормальных транскриптов
14.2. Деградация аберрантных транскриптов
14.3. Заключение
Литература
Глава 15. Транскриптомика (РНомика)
15.1. Нозерн-гибридизация
15.2. ДНК-микрочипы
15.3. Метод SAGE
15.4. Полимеразная цепная реакция в реальном
времени
15.5. Заключение
Литература
Заключение